Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms