Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms