Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms