Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP27

Sfr1, Swi5-dependent recombination DNA repair protein 1 homolog, mousemouse

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfr1Q8BP27 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfr1Q8BP27 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfr1Q8BP27 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfr1Q8BP27 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfr1Q8BP27 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfr1Q8BP27 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfr1Q8BP27 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfr1Q8BP27 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Sfr1Q8BP27 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfr1Q8BP27 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfr1Q8BP27 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfr1Q8BP27 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfr1Q8BP27 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfr1Q8BP27 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Sfr1Q8BP27 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfr1Q8BP27 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfr1Q8BP27 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfr1Q8BP27 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Sfr1Q8BP27 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Sfr1Q8BP27 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfr1Q8BP27 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfr1Q8BP27 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Sfr1Q8BP27 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Sfr1Q8BP27 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfr1Q8BP27 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Sfr1Q8BP27 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfr1Q8BP27 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfr1Q8BP27 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Sfr1Q8BP27 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Sfr1Q8BP27 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfr1Q8BP27 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfr1Q8BP27 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Sfr1Q8BP27 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfr1Q8BP27 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Sfr1Q8BP27 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfr1Q8BP27 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfr1Q8BP27 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Sfr1Q8BP27 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Sfr1Q8BP27 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Sfr1Q8BP27 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfr1Q8BP27 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfr1Q8BP27 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfr1Q8BP27 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfr1Q8BP27 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfr1Q8BP27 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfr1Q8BP27 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfr1Q8BP27 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfr1Q8BP27 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfr1Q8BP27 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfr1Q8BP27 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfr1Q8BP27 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfr1Q8BP27 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfr1Q8BP27 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfr1Q8BP27 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfr1Q8BP27 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfr1Q8BP27 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfr1Q8BP27 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfr1Q8BP27 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfr1Q8BP27 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfr1Q8BP27 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfr1Q8BP27 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfr1Q8BP27 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfr1Q8BP27 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfr1Q8BP27 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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