Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLY2

Tarsl2, Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarsl2Q8BLY2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tarsl2Q8BLY2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tarsl2Q8BLY2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tarsl2Q8BLY2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tarsl2Q8BLY2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tarsl2Q8BLY2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tarsl2Q8BLY2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tarsl2Q8BLY2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tarsl2Q8BLY2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tarsl2Q8BLY2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tarsl2Q8BLY2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tarsl2Q8BLY2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tarsl2Q8BLY2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tarsl2Q8BLY2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tarsl2Q8BLY2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tarsl2Q8BLY2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tarsl2Q8BLY2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tarsl2Q8BLY2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tarsl2Q8BLY2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tarsl2Q8BLY2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tarsl2Q8BLY2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tarsl2Q8BLY2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tarsl2Q8BLY2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tarsl2Q8BLY2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tarsl2Q8BLY2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tarsl2Q8BLY2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tarsl2Q8BLY2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tarsl2Q8BLY2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tarsl2Q8BLY2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tarsl2Q8BLY2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tarsl2Q8BLY2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tarsl2Q8BLY2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tarsl2Q8BLY2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tarsl2Q8BLY2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms