Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII3

D130040H23Rik, RIKEN cDNA D130040H23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130040H23RikQ8BII3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
D130040H23RikQ8BII3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms