Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ubash3bQ8BGG7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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