Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg2bQ80XK6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms