Protein–RNA interactions for Protein: Q80XC6

Nrde2, Protein NRDE2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrde2Q80XC6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms