Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms