Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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