Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms