Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ubfd1Q78JW9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ubfd1Q78JW9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ubfd1Q78JW9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ubfd1Q78JW9 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ubfd1Q78JW9 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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