Protein–RNA interactions for Protein: Q78IQ7

Slc39a4, Zinc transporter ZIP4, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc39a4Q78IQ7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc39a4Q78IQ7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms