Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms