Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHP6

Lrrn2, Leucine rich repeat protein 2, neuronal, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn2Q6PHP6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Lrrn2Q6PHP6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Lrrn2Q6PHP6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Lrrn2Q6PHP6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Lrrn2Q6PHP6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Lrrn2Q6PHP6 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrn2Q6PHP6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms