Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmeff1Q6PFE7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmeff1Q6PFE7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmeff1Q6PFE7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmeff1Q6PFE7 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmeff1Q6PFE7 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmeff1Q6PFE7 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmeff1Q6PFE7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmeff1Q6PFE7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmeff1Q6PFE7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmeff1Q6PFE7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmeff1Q6PFE7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmeff1Q6PFE7 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmeff1Q6PFE7 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmeff1Q6PFE7 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmeff1Q6PFE7 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmeff1Q6PFE7 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmeff1Q6PFE7 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmeff1Q6PFE7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmeff1Q6PFE7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmeff1Q6PFE7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmeff1Q6PFE7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmeff1Q6PFE7 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmeff1Q6PFE7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmeff1Q6PFE7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmeff1Q6PFE7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmeff1Q6PFE7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmeff1Q6PFE7 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmeff1Q6PFE7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmeff1Q6PFE7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmeff1Q6PFE7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmeff1Q6PFE7 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmeff1Q6PFE7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmeff1Q6PFE7 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmeff1Q6PFE7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmeff1Q6PFE7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmeff1Q6PFE7 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmeff1Q6PFE7 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmeff1Q6PFE7 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmeff1Q6PFE7 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmeff1Q6PFE7 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmeff1Q6PFE7 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmeff1Q6PFE7 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Tmeff1Q6PFE7 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmeff1Q6PFE7 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmeff1Q6PFE7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmeff1Q6PFE7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmeff1Q6PFE7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmeff1Q6PFE7 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Tmeff1Q6PFE7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Tmeff1Q6PFE7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmeff1Q6PFE7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmeff1Q6PFE7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmeff1Q6PFE7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmeff1Q6PFE7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmeff1Q6PFE7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmeff1Q6PFE7 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmeff1Q6PFE7 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmeff1Q6PFE7 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmeff1Q6PFE7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmeff1Q6PFE7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmeff1Q6PFE7 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmeff1Q6PFE7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmeff1Q6PFE7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmeff1Q6PFE7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Tmeff1Q6PFE7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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