Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Mfsd13aQ6PDE8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mfsd13aQ6PDE8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms