Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB66

Lrpprc, Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LrpprcQ6PB66 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LrpprcQ6PB66 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LrpprcQ6PB66 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LrpprcQ6PB66 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LrpprcQ6PB66 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LrpprcQ6PB66 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LrpprcQ6PB66 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LrpprcQ6PB66 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LrpprcQ6PB66 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LrpprcQ6PB66 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LrpprcQ6PB66 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LrpprcQ6PB66 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LrpprcQ6PB66 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LrpprcQ6PB66 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LrpprcQ6PB66 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LrpprcQ6PB66 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LrpprcQ6PB66 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LrpprcQ6PB66 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LrpprcQ6PB66 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LrpprcQ6PB66 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LrpprcQ6PB66 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LrpprcQ6PB66 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LrpprcQ6PB66 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LrpprcQ6PB66 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LrpprcQ6PB66 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms