Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms