Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms