Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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