Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CltcQ68FD5 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CltcQ68FD5 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CltcQ68FD5 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CltcQ68FD5 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms