Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrc8eQ66JT1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrc8eQ66JT1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrc8eQ66JT1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrc8eQ66JT1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrc8eQ66JT1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrc8eQ66JT1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrc8eQ66JT1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrc8eQ66JT1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc8eQ66JT1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc8eQ66JT1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc8eQ66JT1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc8eQ66JT1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc8eQ66JT1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc8eQ66JT1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc8eQ66JT1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc8eQ66JT1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc8eQ66JT1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc8eQ66JT1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc8eQ66JT1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc8eQ66JT1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc8eQ66JT1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc8eQ66JT1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc8eQ66JT1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc8eQ66JT1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc8eQ66JT1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc8eQ66JT1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc8eQ66JT1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc8eQ66JT1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc8eQ66JT1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc8eQ66JT1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc8eQ66JT1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc8eQ66JT1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc8eQ66JT1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc8eQ66JT1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc8eQ66JT1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc8eQ66JT1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc8eQ66JT1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc8eQ66JT1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc8eQ66JT1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc8eQ66JT1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc8eQ66JT1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc8eQ66JT1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc8eQ66JT1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc8eQ66JT1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc8eQ66JT1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc8eQ66JT1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc8eQ66JT1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc8eQ66JT1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc8eQ66JT1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc8eQ66JT1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc8eQ66JT1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc8eQ66JT1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc8eQ66JT1 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc8eQ66JT1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc8eQ66JT1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc8eQ66JT1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc8eQ66JT1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc8eQ66JT1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc8eQ66JT1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc8eQ66JT1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms