Protein–RNA interactions for Protein: Q64008

Rab34, Ras-related protein Rab-34, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab34Q64008 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Rab34Q64008 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Rab34Q64008 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Rab34Q64008 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab34Q64008 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms