Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

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Length 748 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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Sema3bQ62177 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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