Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms