Protein–RNA interactions for Protein: Q61495

Dsg1a, Desmoglein-1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1aQ61495 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg1aQ61495 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms