Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc1Q60596 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc1Q60596 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms