Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms