Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms