Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYD0

Myo1d, Unconventional myosin-Id, mousemouse

Predictions only

Length 1,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1dQ5SYD0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Myo1dQ5SYD0 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Myo1dQ5SYD0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Myo1dQ5SYD0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Myo1dQ5SYD0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Myo1dQ5SYD0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Myo1dQ5SYD0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Myo1dQ5SYD0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Myo1dQ5SYD0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Myo1dQ5SYD0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Myo1dQ5SYD0 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Myo1dQ5SYD0 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Myo1dQ5SYD0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Myo1dQ5SYD0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Myo1dQ5SYD0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Myo1dQ5SYD0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Myo1dQ5SYD0 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Myo1dQ5SYD0 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Myo1dQ5SYD0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Myo1dQ5SYD0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Myo1dQ5SYD0 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Myo1dQ5SYD0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Myo1dQ5SYD0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Myo1dQ5SYD0 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Myo1dQ5SYD0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Myo1dQ5SYD0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Myo1dQ5SYD0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Myo1dQ5SYD0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms