Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRT8

Ccnjl, Cyclin-J-like protein, mousemouse

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnjlQ5SRT8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnjlQ5SRT8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CcnjlQ5SRT8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CcnjlQ5SRT8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CcnjlQ5SRT8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CcnjlQ5SRT8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CcnjlQ5SRT8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnjlQ5SRT8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnjlQ5SRT8 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnjlQ5SRT8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnjlQ5SRT8 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnjlQ5SRT8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnjlQ5SRT8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnjlQ5SRT8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnjlQ5SRT8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnjlQ5SRT8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnjlQ5SRT8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnjlQ5SRT8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms