Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms