Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Taf3Q5HZG4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Taf3Q5HZG4 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Taf3Q5HZG4 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf3Q5HZG4 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf3Q5HZG4 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf3Q5HZG4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf3Q5HZG4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf3Q5HZG4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf3Q5HZG4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf3Q5HZG4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf3Q5HZG4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf3Q5HZG4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf3Q5HZG4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf3Q5HZG4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf3Q5HZG4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf3Q5HZG4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf3Q5HZG4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf3Q5HZG4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf3Q5HZG4 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf3Q5HZG4 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf3Q5HZG4 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf3Q5HZG4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf3Q5HZG4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf3Q5HZG4 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf3Q5HZG4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf3Q5HZG4 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf3Q5HZG4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf3Q5HZG4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf3Q5HZG4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf3Q5HZG4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf3Q5HZG4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf3Q5HZG4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf3Q5HZG4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf3Q5HZG4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf3Q5HZG4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf3Q5HZG4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf3Q5HZG4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf3Q5HZG4 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf3Q5HZG4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf3Q5HZG4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf3Q5HZG4 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf3Q5HZG4 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf3Q5HZG4 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf3Q5HZG4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf3Q5HZG4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf3Q5HZG4 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf3Q5HZG4 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf3Q5HZG4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf3Q5HZG4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf3Q5HZG4 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms