Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms