Protein–RNA interactions for Protein: Q5D525

Syce1l, Synaptonemal complex central element protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1lQ5D525 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms