Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms