Protein–RNA interactions for Protein: Q3V460

Smim26, Gene model 561, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim26Q3V460 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms