Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms