Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

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Length 621 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Ccdc185Q3V118 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Ccdc185Q3V118 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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Ccdc185Q3V118 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Ccdc185Q3V118 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Ccdc185Q3V118 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Ccdc185Q3V118 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Ccdc185Q3V118 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Ccdc185Q3V118 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Ccdc185Q3V118 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Ccdc185Q3V118 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms