Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms