Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ccdc160Q3UYG1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ccdc160Q3UYG1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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