Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms