Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHG7

Lchn, Protein LCHN, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LchnQ3UHG7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms