Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q3U6N9 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q3U6N9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q3U6N9 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q3U6N9 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q3U6N9 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q3U6N9 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q3U6N9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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