Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc136Q3TVA9 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc136Q3TVA9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc136Q3TVA9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc136Q3TVA9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc136Q3TVA9 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc136Q3TVA9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc136Q3TVA9 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc136Q3TVA9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc136Q3TVA9 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc136Q3TVA9 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc136Q3TVA9 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc136Q3TVA9 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc136Q3TVA9 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc136Q3TVA9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc136Q3TVA9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc136Q3TVA9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc136Q3TVA9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc136Q3TVA9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc136Q3TVA9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc136Q3TVA9 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc136Q3TVA9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc136Q3TVA9 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc136Q3TVA9 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc136Q3TVA9 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc136Q3TVA9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc136Q3TVA9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc136Q3TVA9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc136Q3TVA9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc136Q3TVA9 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc136Q3TVA9 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc136Q3TVA9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc136Q3TVA9 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc136Q3TVA9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc136Q3TVA9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc136Q3TVA9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc136Q3TVA9 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc136Q3TVA9 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc136Q3TVA9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc136Q3TVA9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc136Q3TVA9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc136Q3TVA9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc136Q3TVA9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc136Q3TVA9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc136Q3TVA9 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc136Q3TVA9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc136Q3TVA9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc136Q3TVA9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc136Q3TVA9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc136Q3TVA9 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms