Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms