Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNH5

Fam172a, Protein FAM172A, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam172aQ3TNH5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam172aQ3TNH5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms