Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNP5

V1rd19, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1rd19Q3KNP5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
V1rd19Q3KNP5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
V1rd19Q3KNP5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
V1rd19Q3KNP5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
V1rd19Q3KNP5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
V1rd19Q3KNP5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
V1rd19Q3KNP5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
V1rd19Q3KNP5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
V1rd19Q3KNP5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
V1rd19Q3KNP5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
V1rd19Q3KNP5 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
V1rd19Q3KNP5 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
V1rd19Q3KNP5 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
V1rd19Q3KNP5 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
V1rd19Q3KNP5 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
V1rd19Q3KNP5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
V1rd19Q3KNP5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
V1rd19Q3KNP5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
V1rd19Q3KNP5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
V1rd19Q3KNP5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
V1rd19Q3KNP5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
V1rd19Q3KNP5 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
V1rd19Q3KNP5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
V1rd19Q3KNP5 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
V1rd19Q3KNP5 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
V1rd19Q3KNP5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
V1rd19Q3KNP5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
V1rd19Q3KNP5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
V1rd19Q3KNP5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
V1rd19Q3KNP5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
V1rd19Q3KNP5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
V1rd19Q3KNP5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
V1rd19Q3KNP5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
V1rd19Q3KNP5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
V1rd19Q3KNP5 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
V1rd19Q3KNP5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
V1rd19Q3KNP5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
V1rd19Q3KNP5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
V1rd19Q3KNP5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
V1rd19Q3KNP5 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
V1rd19Q3KNP5 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
V1rd19Q3KNP5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
V1rd19Q3KNP5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
V1rd19Q3KNP5 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
V1rd19Q3KNP5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
V1rd19Q3KNP5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
V1rd19Q3KNP5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
V1rd19Q3KNP5 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
V1rd19Q3KNP5 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
V1rd19Q3KNP5 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
V1rd19Q3KNP5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
V1rd19Q3KNP5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
V1rd19Q3KNP5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
V1rd19Q3KNP5 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
V1rd19Q3KNP5 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
V1rd19Q3KNP5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
V1rd19Q3KNP5 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
V1rd19Q3KNP5 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
V1rd19Q3KNP5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
V1rd19Q3KNP5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
V1rd19Q3KNP5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
V1rd19Q3KNP5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
V1rd19Q3KNP5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
V1rd19Q3KNP5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
V1rd19Q3KNP5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
V1rd19Q3KNP5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
V1rd19Q3KNP5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
V1rd19Q3KNP5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
V1rd19Q3KNP5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
V1rd19Q3KNP5 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
V1rd19Q3KNP5 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
V1rd19Q3KNP5 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
V1rd19Q3KNP5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
V1rd19Q3KNP5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
V1rd19Q3KNP5 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
V1rd19Q3KNP5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
V1rd19Q3KNP5 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
V1rd19Q3KNP5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
V1rd19Q3KNP5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
V1rd19Q3KNP5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
V1rd19Q3KNP5 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
V1rd19Q3KNP5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
V1rd19Q3KNP5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
V1rd19Q3KNP5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
V1rd19Q3KNP5 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
V1rd19Q3KNP5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
V1rd19Q3KNP5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
V1rd19Q3KNP5 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
V1rd19Q3KNP5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
V1rd19Q3KNP5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
V1rd19Q3KNP5 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
V1rd19Q3KNP5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
V1rd19Q3KNP5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
V1rd19Q3KNP5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
V1rd19Q3KNP5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
V1rd19Q3KNP5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
V1rd19Q3KNP5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
V1rd19Q3KNP5 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
V1rd19Q3KNP5 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
V1rd19Q3KNP5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms